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组蛋白甲基化涉及两类酶:甲基转移酶和去甲基化酶。虽然甲基转移酶负责建立甲基化模式,但去甲基化酶不仅能从组蛋白中除去甲基,还能除去其他蛋白质。组蛋白去甲基化酶不仅靶向组蛋白尾部的甲基化位点,还与非组蛋白蛋白(例如p53)上的甲基化位点相互作用。组蛋白赖氨酸脱甲基酶(KDM)由于其在染色质组织中的调节作用以及它们与包括癌症和精神障碍在内的疾病的紧密关联而作为药物靶标受到关注。 JMJD1A(也称为KDM3A)是从组蛋白赖氨酸H3K9中去除甲基的去甲基化合物。它在各种细胞过程中发挥重要作用,包括精子发生,能量代谢,干细胞调节和性别展示。含有Jumonji结构域的3(Jmjd3)已被鉴定为组蛋白去甲基化酶,其特异性催化从H3K27me3中去除甲基化。


抗感染 >
沙粒 细菌 CMV 肠道病毒 丝状病毒 真菌 HBV HCV HIV HSV 流感病毒 寄生物 逆转录酶 RSV SARS冠状病毒
抗体- 药物偶联物 >
ADC细胞毒素 ADC连接器 Drug-Linker Conjugates for ADC 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
细胞凋亡 >
细胞凋亡 Bcl-2家族 c-Myc的 胱天蛋白酶 DAPK Ferroptosis IAP MDM-2/p53 PKD RIP激酶 存活 胸苷酸合成酶 TNF受体
自噬 >
自噬 LRRK2 ULK 自噬
细胞周期/DNA损伤 >
叶酸 APC ATM/ATR 极光激酶 酪蛋白激酶 CDK 检查点激酶(Chk) CRISPR/Cas9 去泛素化酶 DNA烷基化剂/交联剂 DNA-PK DNA/RNA合成 真核起始因子(eIF) G-四链体 Haspin激酶 HDAC HSP IRE1 驱动蛋白 LIM激酶(LIMK) 微管/微管蛋白 MPS1 核苷抗代谢药/类似物 P97 PAK PARP PERK Polo样激酶(PLK) PPAR RAD51 岩石 抗衰老酶 SRPK 端粒酶 TOPK 拓扑异构酶 WEE1
细胞骨架 >
Arp2/3复合物 动力素 间隙连接蛋白 Integrin 驱动蛋白 微管/微管蛋白 MPS1 肌球蛋白 PAK
表观遗传学 >
AMPK 极光激酶 DNA甲基转移酶 表观遗传读者域 HDAC 组蛋白乙酰转移酶 组蛋白去甲基化酶 组蛋白甲基转移酶 JAK 微RNA PARP PKC 抗衰老酶 蛋白质精氨酸脱亚胺酶
G 蛋白偶联受体/G 蛋白 >
5-HT受体 腺苷受体 腺苷酸环化酶 脂联素受体 肾上腺素能受体 血管紧张素受体 Bombesin Receptor 缓激肽受体 大麻素受体 CaSR的 CCR CGRP受体 胆囊收缩素受体 CRFR CXCR 多巴胺受体 EBI2/GPR183 内皮素受体 GHSR 胰高血糖素受体 糖皮质激素受体 GNRH受体 GPCR19 GPR109A GPR119 GPR120 GPR139 GPR40 GPR55 GPR84 鸟苷酸环化酶 组胺受体 咪唑啉受体 白三烯受体 LPL受体 由mAChR MCHR1(GPR24) 褪黑激素受体 谷氨酸受体 Motilin Receptor 神经激肽受体 神经肽Y受体 神经降压素受体 阿片受体 食欲素受体(OX受体) 催产素受体 P2Y受体 前列腺素受体 蛋白酶激活受体(PAR) 拉斯 RGS蛋白质 Sigma Receptor 生长抑素受体 TSH受体 Urotensin Receptor 血管加压素受体 黑皮素受体
免疫及炎症 >
芳基烃受体 CCR 补充系统 COX CXCR FLAP 组胺受体 IFNAR 白细胞介素相关 IRAK MyD88的 一氧化氮合酶 NOD样受体(NLR) PD-1/PD-L1 PGE合成酶 盐诱导激酶(SIK) SPHK 血小板生成素受体 Toll样受体(TLR) 精氨酸
JAK/STAT信号通路 >
EGFR JAK 皮姆 STAT
MAPK/ERK信号通路 >
ERK JNK KLF MAP3K MAP4K MAPKAPK2(MK2) MEK 混合谱系激酶 MNK p38 MAPK 拉夫 核糖体S6激酶(RSK)
跨膜转运 >
ATP合成酶 BCRP 钙通道 CFTR 氯离子通道 CRAC频道 CRM1 EAAT2 GABA受体 GLYT HCN频道 iGluR 单胺转运蛋白 单羧酸转运蛋白 Na+/Ca2+交换器 Na+/HCO3-协同转运蛋白 Na+/K+ATP酶 胆碱受体 NKCC P-糖蛋白 P2X受体 钾通道 质子泵 SGLT 钠通道 TRP频道 URAT1
代谢酶/蛋白酶 >
15-PGDH 5 alpha还原酶 5脂氧合酶 乙酰辅酶A羧化酶 酰基转移酶 腺苷脱氨酶 腺苷激酶 醛脱氢酶(ALDH) 醛糖还原酶 氨肽酶 血管紧张素转换酶(ACE) ATGL ATP柠檬酸裂解酶 碳酸酐酶 组织蛋白酶 CETP COMT 细胞色素P450 二肽基肽酶 多巴胺β-羟化酶 E1/E2/E3酶 弹性蛋白酶 烯醇化酶 FAAH FABP 因子Xa 法呢基转移酶 脂肪酸合成酶(FAS) FXR 葡萄糖激酶 GSNOR 谷胱甘肽S-转移酶 HCV蛋白酶 己糖激酶 HIF/HIF脯氨酰-羟化酶 艾滋病毒整合酶 HIV蛋白酶 HMG-CoA还原酶(HMGCR) HSP 吲哚胺2,3-二氧化酶(IDO) 异柠檬酸脱氢酶(IDH) 乳酸脱氢酶 LXR MAGL 盐皮质激素受体 线粒体代谢 MMP NAMPT NEDD8活化酶 脑啡肽酶 PAI-1 PDHK PGC-1α 磷酸酶 磷酸二酯酶(PDE) 磷脂 前胶原C蛋白酶 蛋白酶体 丙酮酸激酶 RAR/RXR 肾素 ROR Ser/Thr蛋白酶 SGK 硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD) 凝血酶 色氨酸羟化酶 酪氨酸酶 黄嘌呤氧化酶
神经信号通路 >
5-HT受体 疼痛 腺苷激酶 β淀粉样蛋白 β-分泌 蛋白激酶 CGRP受体 COMT 多巴胺受体 多巴胺转运蛋白 FAAH GABA受体 GLYT iGluR 咪唑啉受体 mAChR 褪黑激素受体 单胺氧化酶 胆碱受体 神经激肽受体 阿片受体 5-羟色胺转运蛋白 γ分泌酶
NF-κB信号通路 >
NF-κB IKK KEAP1-Nrf2 MALT1
PI3K/Akt/mTOR 信号通路 >
AKT AMPK ATM/ATR DNA-PK GSK-3 MELK mTOR PDK-1 PI3K PI4K PIKfyve PTEN
蛋白裂解靶向嵌合体 >
PROTAC E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate E3 Ligase的配体 PROTAC Linker 用于PAC的PROTAC-连接子共轭物
蛋白酪氨酸激酶 >
ACK1 ALK BCR-ABL BMX激酶 BTK c-FMS c-Kit c-Met的/HGFR 盘基蛋白结构域受体 DYRK EGFR 艾弗林受体 FAK FGFR FLT3 IGF-1R 胰岛素受体 IRAK ITK PDGFR PKA PYK2 ROS SRC SYK TAM Receptor Trk Receptor VEGFR
干细胞及 Wnt 通路 >
酪蛋白激酶 ERK GLI GSK-3 Hedgehog Hippo (MST) JAK Notch OCT3/4 PKA 豪猪 岩石 SFRP-1 SMO STAT TGF-β/Smad蛋白 Wnt信号 YAP β-catenin γ分泌酶
TGF-beta/Smad 信号通路 >
TGF-β/Smad蛋白 PKC 岩石 TGF-β受体
维生素 D 相关 >
VD/VDR
其他 >
雄激素受体 芳香 雌激素受体/ERR 孕激素受体 甲状腺激素受体 其他

NCGC00244536

NCGC00244536是高效的 KDM4B 抑制剂,IC50 值为10 nM。

  • CAS号:2003260-55-5
  • 分子式:C25H22N2O2
  • 分子量:382.45
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

S2101

S 2101 是一个赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 抑制剂,其 IC50 值为 0.99 μM, Ki 值为 0.61 μM,Kinact/Ki 值为 4560 M/s。

  • CAS号:1239262-36-2
  • 分子式:
  • 分子量:311.75
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

5-氯-2(1H)-吡啶酮 (2E)-(苯基-2-吡啶基亚甲基)腙

JIB-04 是 Jumonji 组蛋白去甲基酶 (Jumonji histone demethylase) 广谱抑制剂,能抑制 JARID1A,JMJD2E,JMJD3,JMJD2A,JMJD2B,JMJD2C 和 JMJD2D 的活性,其 IC50 值分别为 230,340,855,445,435,1100 和 290 nM。

  • CAS号:199596-05-9
  • 分子式:C17H13ClN4
  • 分子量:308.765
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.2±0.1 g/cm3
  • 沸点:472.9±55.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:239.8±31.5 °C

科林

Corin 是组氨酸赖氨酸特异性去甲基化酶 (LSD1) 和组氨酸脱乙酰化酶 (HDAC) 的双重抑制剂,其对 LSD1 的 Ki(inact) 值为 110 nM,对 HDAC1 的 IC50 值为 147 nM。

  • CAS号:1808113-09-8
  • 分子式:C26H28N4O2
  • 分子量:428.53
  • 类别:HDAC
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

QC6352

QC6352 是一种有效的 KDM4C 抑制剂,其 IC50 值为 35 nM。

  • CAS号:1851373-36-8
  • 分子式:
  • 分子量:387.47
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

SP2509

SP2509 是有效的,选择性的 LSD1 拮抗剂,IC50 值为 13 nM。

  • CAS号:1423715-09-6
  • 分子式:C19H20ClN3O5S
  • 分子量:437.897
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.4±0.1 g/cm3
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

DDP-38003二盐酸盐

DDP-38003 dihydrochloride是新颖有口服活性的KDM1A/LSD1抑制剂,IC50值为84 nM。

  • CAS号:1831167-98-6
  • 分子式:C21H28Cl2N4O
  • 分子量:423.379
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

KDM4D-IN-1

KDM4D-IN-1 是一种新型组蛋白赖氨酸去甲基化酶 4D (KDM4D) 抑制剂,IC50 为 0.41±0.03 μM。

  • CAS号:2098902-68-0
  • 分子式:C11H7N5O
  • 分子量:225.21
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

反苯环丙胺半硫酸盐

Tranylcypromine hemisulfate是一种用于治疗抑郁症的不可逆,非选择性 MAO 抑制剂。

  • CAS号:13492-01-8
  • 分子式:C9H12NO2S0.5
  • 分子量:182.23
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.065g/cm3
  • 沸点:218.3C at 760mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:90.8C

CBB1007

CBB1007可渗透入细胞,是hLSD1的选择性抑制剂,IC50为5.27 μM。

  • CAS号:1379573-92-8
  • 分子式:C27H34N8O4
  • 分子量:534.610
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.4±0.1 g/cm3
  • 沸点:763.8±70.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:415.7±35.7 °C

LSD1-IN-5

LSD1-in-1 (Compound 4e) 是一种有效、可逆的赖氨酸特异性去甲基化酶 (LSD1) 抑制剂,IC50 值为 121 nM。LSD1-in-1 能增加组蛋白 H3 Lys4 的二甲基化,但对 LSD1 的表达无作用。

  • CAS号:2035912-55-9
  • 分子式:C15H13BrN2O3
  • 分子量:349.18
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

YUKA1

YUKA1 是一种有效、可透过细胞的赖氨酸脱甲基化酶 (KDM5A) 抑制剂,IC50 值为 2.66 μM,对 KDM5C 的作用较弱,IC50 值为 7.12 μM,对 KDM5B,KDM6A 或 KDM6B 无所用。YUKA1 可增加人细胞中 H3K4me3 的水平,具有抗肿瘤活性。

  • CAS号:708991-09-7
  • 分子式:C13H16N4O2S
  • 分子量:292.36
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

GSK-J2

GSK-J2 是 GSK-J1 的对映异构体,没有特殊活性。GSK-J1 是 H3K27me3/me2-demethylases JMJD3/KDM6B 和 UTX/KDM6A 的抑制剂。

  • CAS号:1394854-52-4
  • 分子式:C22H23N5O2
  • 分子量:389.45
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

PBIT

PBIT 是一种特异性的 Jumonji/AT 富集互作结构域 1 (JARID1) 抑制剂。PBIT 抑制 JARID1B (KDM5B 或 PLU1) 组蛋白去甲基化酶, IC50 值约为 3 μM。 PBIT 还抑制 JARID1A 和 JARID1C,IC50 分别为 6 和 4.9 μM。

  • CAS号:2514-30-9
  • 分子式:C14H11NOS
  • 分子量:241.31
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.3±0.1 g/cm3
  • 沸点:418.2±38.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:206.7±26.8 °C

GSK2879552

GSK2879552 是一种可口服的,不可逆的 LSD1 抑制剂,具有抗肿瘤活性。

  • CAS号:1401966-69-5
  • 分子式:C23H28N2O2
  • 分子量:364.48100
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

CBB1003

CBB1003是组蛋白去甲基化酶LSD1抑制剂,IC50值为10.54uM。

  • CAS号:1379573-88-2
  • 分子式:C25H31N9O4
  • 分子量:521.57200
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

6-异丙基-7-氧代-5-苯基-4,7-二氢吡唑并[1,5-A]嘧啶-3-腈

CPI-455 是一种有效的特异性 KDM5 抑制剂。

  • CAS号:1628208-23-0
  • 分子式:C16H14N4O
  • 分子量:278.309
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.3±0.1 g/cm3
  • 沸点:488.7±55.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:249.3±31.5 °C

Vafidemstat

Vafidemstat 是一种双重的赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶 (LSD1)/MAO-B 抑制剂。

  • CAS号:1357362-02-7
  • 分子式:C19H20N4O2
  • 分子量:336.39
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

丁酰肼

Daminozide(DMASA; DIMG; B 995)为植物生长调节剂,能选择性抑制KDM2/7 JmjC亚家族。

  • CAS号:1596-84-5
  • 分子式:C6H12N2O3
  • 分子量:160.171
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.2±0.1 g/cm3
  • 沸点:329.5±44.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:162-164°C(lit.)
  • 闪点:153.1±28.4 °C

N-[2-(2-吡啶基)-6-(1,2,4,5-四氢-3H-3-苯并氮杂卓-3-基)-4-嘧啶基]-BETA-丙氨酸

GSK-J1 是 H3K27me3/me2-demethylases JMJD3/KDM6B 和 UTX/KDM6A 的抑制剂,对 KDM6B 的 IC50 值为 60 nM。

  • CAS号:1373422-53-7
  • 分子式:C22H23N5O2
  • 分子量:389.450
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.3±0.1 g/cm3
  • 沸点:608.9±55.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:322.0±31.5 °C

T-448

T-448 是赖氨酸特异性去甲基化酶1 (LSD1,一种H3K4去甲基化酶) 不可逆的抑制剂,IC50 值为 22 nM。T-448能够加强原代培养的大鼠神经元中H3K4的甲基化。

  • CAS号:1597426-53-3
  • 分子式:C38H44N8O6S2
  • 分子量:772.94
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

NCGC00247743

NCGC00247743 是一种组蛋白赖氨酸脱甲基酶 KDM4 抑制剂。

  • CAS号:1435192-04-3
  • 分子式:C24H29N3O2
  • 分子量:391.51
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

GSK467

GSK467 是一种有效选择性的 KDM5 (也称 JARID1) 抑制剂,Ki 值为 10 nM,是 KDM4C 选择性的 180 倍,而对 KDM6 或其他 Jumonji 家族成员没有明显的抑制作用。

  • CAS号:1628332-52-4
  • 分子式:C17H13N5O2
  • 分子量:319.32
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

Seclidemstat

Seclidemstat (SP-2577) 是一种有效的 LSD1 抑制剂,平均 IC50 值为 127 nM。

  • CAS号:1423715-37-0
  • 分子式:C20H23ClN4O4S
  • 分子量:450.939
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.4±0.1 g/cm3
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

LSD1-IN-6

LSD1-in-2 (Compound 4m) 是一种有效、可逆的赖氨酸特异性去甲基化酶 (LSD1) 抑制剂,IC50 值为 123 nM。LSD1-in-2 (4m) 能增加组蛋白 H3 Lys4 的二甲基化,但对 LSD1 的表达无作用。

  • CAS号:2035912-43-5
  • 分子式:C15H13BrN2O3
  • 分子量:349.18
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

T-3775440盐酸盐

T-3775440 (hydrochloride) 是一种赖氨酸特异性脱甲基酶1 (LSD1) 的不可逆性抑制剂,其 IC50 值为 2.1 nM。

  • CAS号:1422535-52-1
  • 分子式:C18H23ClN4O
  • 分子量:346.85
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A

KDM5-IN-1

KDM5-IN-1是高效选择,有口服活性的KDM5抑制剂,IC50值为15.1 nM。

  • CAS号:1628210-26-3
  • 分子式:C17H20N6O
  • 分子量:324.380
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.3±0.1 g/cm3
  • 沸点:527.0±60.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:272.5±32.9 °C

ML324

ML324是JMJD2去甲基酶抑制剂,被证实有抗病毒作用。

  • CAS号:1222800-79-4
  • 分子式:C21H23N3O2
  • 分子量:349.426
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.2±0.1 g/cm3
  • 沸点:590.1±50.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:310.7±30.1 °C

5-羰基-8-羟基喹啉

IOX1是2OG oxygenase高效广谱抑制剂,包括JmjC去甲基化酶家族,对KDM4A和KDM3A的IC50值分别为0.6uM和0.1uM。

  • CAS号:5852-78-8
  • 分子式:C10H7NO3
  • 分子量:189.167
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:1.5±0.1 g/cm3
  • 沸点:464.5±30.0 °C at 760 mmHg
  • 熔点:N/A
  • 闪点:234.7±24.6 °C

ORY-1001(反式)

ORY-1001 trans 是一种不可逆的选择性赖氨酸特异性脱甲基酶 1A (KDM1A/LSD1) 抑制剂

  • CAS号:1431303-72-8
  • 分子式:C15H24Cl2N2
  • 分子量:303.271
  • 类别:组蛋白去甲基化酶
  • 密度:N/A
  • 沸点:N/A
  • 熔点:N/A
  • 闪点:N/A